Томское областное отделение Русского географического общества основано в 27 января 1948 года на базе географического отделения Томского государственного университета (ТГУ). Деятельность отделения была направлена на поддержку исследований природных ресурсов Западной Сибири.

26 мая 2015 года на территории университета состоялось отчетно-выборное собрание Томского областного отделения РГО. Подведены итоги работы отделения, обозначены новые направления в его деятельности с учетом задач и решений XV съезда Русского географического общества, итогов Первого фестиваля Русского географического общества.

Руководивший отделением на протяжении 25 лет профессор ТГУ Петр Андреевич Окишев избран Почетным Председателем Томского областного отделения РГО.

Новым председателем отделения избран ректор Национального исследовательского Томского государственного университета, профессор Эдуард Владимирович Галажинский.

Попечительский совет отделения возглавляет Губернатор Томской области Сергей Анатольевич Жвачкин.

23 апреля 2019 года Томское отделение получило малую серебряную медаль РГО из рук Владимира Путина за активную исследовательскую деятельность Сибири, России и мира.